Pravilnikom o troškovima koje snose treća lica pred Agencijom za upravljanje, usvojenim na XXIV sednici UO , br. 342-118/1/2015 od 09.04.2015. godine, utvrđeno je da Agencija naplaćuje usluge trećim licima.
Ovim pravilnikom utvrđuju se vrsta i visina troškova koje Agencija za upravljanje lukama naplaćuje trećim licima. Troškove snose privredni subjekti i druga pravna lica u postupku: izbora lučkog operatera, utvrđivanja novog ili proširenja postojećeg lučkog područja, davanja odobrenja za obavljanje lučkih delatnosti, davanja odobrenja za koncesije i drugih odobrenja, saglasnosti i uslova, u skladu sa Zakonom o plovidbi i lukama na unutrašnjim vodama.